在一项涉及血流动力学稳定患者的开放研究中，与普通肝素相比，静脉溶栓治疗能减少临床恶化率（主要是再次溶栓的必要），但并不减少死亡率。静脉溶栓治疗与右室功能障碍更快恢复相关，但是1周时右室功能障碍的程度在两个治疗组相似。直接导管溶栓与静脉溶栓无明显差异。
　　血流动力学不稳定的患者更需积极治疗，如药物溶栓或机械性溶栓。患者死亡率高和溶栓比抗凝治疗能使血栓栓塞更快溶解，说明应进行溶栓治疗。未治疗的患者死亡率高达60％，右心血栓的患者死亡率更高，及时治疗死亡率可以减少到小于30％。最新荟萃分析显示，静脉溶栓与血流动力学不稳定肺栓塞患者死亡率的降低相关。静脉溶栓大出血比抗凝治疗更常见。溶栓治疗的主要禁忌证为颅内疾病、未控制的高血压、近期外科大型手术或创伤（3周内）。
　　在急性肺栓塞患者中比较不同溶栓剂的研究未得出令人信服的结果。推荐短时间（≤2 h）而不是较长时间给药方案，因可以更快速溶栓，并可减少出血风险。在肺栓塞患者中，静脉注射普通肝素是唯一与溶栓治疗联合使用的抗凝剂。所以，溶栓治疗把静脉注射普通肝素作为起始抗凝是合适的。经皮机械性血栓切除术（碎栓和抽吸）和外科栓子切除术仅限于有溶栓治疗绝对禁忌证的高危患者和溶栓治疗无效的患者；在无体外循环时，经皮机械性血栓切除术可作为外科栓子切除术的替代治疗。最近的荟萃分析显示，直接导管治疗的临床成功率为86％，手术并发症为2.4％(95％CI：1.9～4.3)。
　　有抗凝治疗禁忌证的患者推荐使用腔静脉滤器。为防止血栓延伸和复发，当患者出血风险消失时应抗凝治疗。病例分析表明